北大附中深圳南山分校成立于2000年5月20日，是由北京大学、香港科技大学和深圳市政府三方合作的深港产学研基地的基础教育发展项目，是深圳市南山区教育局和北京大学附属中学联合创办的寄宿制国有民办学校。北大附中深圳南山分校坐落于前海自贸区，东接深南大道高新科技园区，西邻月亮湾大道，南抵大新地铁站，北眺荷兰花卉小镇，毗邻景色秀美的中山公园，具有便利的交通环境以及优越的人文地理环境，校园占地面积4万平方米，投资规模二亿七千万元，各类场馆设施齐全，教育教学设备具有国内一流水准。现有小学、初中、高中、国际部共92个教学班，在校学生3000多人，教职工300多人。

北大附中深圳南山分校是广东省一级学校，广东省首届十佳民办学校，首个广东省普通高中教学水平优秀民办学校，成立十五年来多次获得“深圳市高考工作先进单位”，历年中考成绩始终位居南山区前茅。学校以创办具有国际先进水平的优秀中国学校为目标，以培养具有终身学习力、多元竞争力、卓越领导力和高度社会责任感的“四力一感”阳光、自主的学生精神气质为目的，积极、成功地践行全面素质教育。如今，北大附中深圳南山分校以其自身强大的优质教育品牌优势和扎扎实实的办学特色获得社会的良好声誉，已在深圳特区民办基础教育领域成为一面领军旗帜。